Objektif - objektif Badan Dakwah dan Rohani SMK Agama Kota Kinabalu termasuklah:
- melahirkan gen pelajar yang berpegang teguh kepada akidah islamiyyah serta mengamalkan syariat dlm kehidupan.
- melahirkan gen pelajar yang bersahsiah tinggi, memiliki akhlak terpuji serta mampu menjadi qudwah dan teladan terbaik.
- melahirkan gen pelajar yang berketerampilan serta dapat melaksanakan tanggungjawab yang diamanahkan.
- melahirkan gen pelajar yang seimbang dalam kecemerlangan akademik dan sahsiah